李树珍,万慧荣,杨光
LI Shuzhen,WAN Huirong,YANG Guang
摘要: 选取江豚基因组中的2 个已知单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,通过PCR 扩增,将PCR 产物按基因频率不同制备成0 ~ 50% 的11 个DNA 池(DNA pool),用于变性高效液相色谱(denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC)和直接测序分析,以探讨DNA 池中基因频率的最低要求。结果显示,当稀有等位基因的基因频率不少于5% 时可在DHPLC 检测过程中明显分辨;而利用DNA 池进行直接测序时的基因频率则需达到10% 。这提示,为保证DHPLC 分析的准确性和可靠性,制备DNA 池时等摩尔DNA 混合的个体数最好不超过10 个。DNA 池结合DHPLC 技术的高效性与准确性可在大规模的SNPs 位点筛选中发挥作用。