基于全基因组重测序的辽宁海域东亚江豚遗传特性研究

doi:10.16829/j.slxb.151080

兽类学报 ›› 2026, Vol. 46 ›› Issue (4): 1-.DOI: 10.16829/j.slxb.151080

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基于全基因组重测序的辽宁海域东亚江豚遗传特性研究

高祥刚^1,2 王震^1,2 鹿志创^1,2 杜静^1,2 邢衍阔^1,2 韩家波^1,2 田甲申^1,2*

（1 辽宁省海洋水产科学研究院，大连 116023）

（2 大连市濒危海洋哺乳动物保护生物学重点实验室，大连 116023）

出版日期:2026-07-30 发布日期:2026-06-03

Online:2026-07-30 Published:2026-06-03

摘要/Abstract

摘要： 为更好地了解分布于辽宁海域的东亚江豚群体结构、遗传差异，为物种保护提供科学依据，本研究采集来源于辽宁海域的 47头东亚江豚北方群体（NSN）的肌肉组织用于全基因组重测序，测序深度为10 ×。随后，从NCBI数据库下载来源于长江口临近海域的东亚江豚南方群体（NSS）、来源于长江流域的长江江豚群体（NA）、来源于福建等海域的印太江豚群体（NP）的江豚序列数据。使用上述4个群体的测序数据进行了遗传多样性分析、遗传结构分析、主成分分析、系统进化树构建，以及遗传分化指数、基因流、遗传距离分析。辽宁海域东亚江豚的观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别为0. 312 3和0. 321 0，是江豚4个群体杂合度较高的群体，说明分布于我国辽宁海域的江豚遗传多样性不低，属于一个大而稳定的种群。系统发育树分析、主成分分析结果和遗传结构分析较一致，皆能区分不同群体，总体上4个群体可以分为3个类群，分为类群 Ⅰ：印太江豚群体（NP），类群 Ⅱ：长江江豚群体（NA），类群 Ⅲ：东亚江豚群体，包括东亚江豚北方群体（NSN）与东亚江豚南方群体（NSS）。NSN与NP的遗传分化指数为0. 178 0、与NA的遗传分化指数为0. 047 8，NSN与NSS的遗传分化指数0. 023 1最小，遗传距离0. 031 9最小，基因流10. 554 5最大。综上所述，分布于辽宁海域的东亚江豚遗传多样性较好，与长江口邻近海域的东亚江豚南方群体同属东亚江豚亚种，基因交流充分，遗传分化较低，可以作为一个管理单位进行保护。

关键词: 全基因组重测序, 东亚江豚, 群体结构, 遗传差异, 辽宁海域

高祥刚, 王震, 鹿志创, 杜静, 邢衍阔, 韩家波, 田甲申. 基于全基因组重测序的辽宁海域东亚江豚遗传特性研究[J]. 兽类学报, 2026, 46(4): 1-.

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