兽类学报 ›› 2026, Vol. 46 ›› Issue (5): 1-.DOI: 10.16829/j.slxb.151162

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秦岭圈养大熊猫幼年与成年期肠道菌群结构及功能差异解析

王斌鹏1 张丹辉2 杨志梅3 潘月婷3 罗晓斌2 莫然1 昝林森3 王晓宇2* 梅楚刚1*
  

  1. (1 西北农林科技大学草业与草原学院,杨凌 712100)

    (2 秦岭大熊猫研究中心(陕西省珍稀野生动物救护基地),西安 710402)

    (3 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌 712100)

  • 出版日期:2026-09-30 发布日期:2026-08-12

  • Online:2026-09-30 Published:2026-08-12

摘要: 本研究旨在通过宏基因组技术探究秦岭圈养大熊猫幼年和成年期肠道菌群结构和功能差异,为阐明秦岭圈养大熊猫的肠道菌群对不同阶段饮食的适应性响应、开发针对提高秦岭圈养大熊猫的促消化益生菌产品和改善其营养健康提供重要的理论依据。试验采集秦岭大熊猫研究中心饲养的3只幼年(2 ~ 4月龄) 和3只成年(62 ~ 63月龄) 大熊猫粪便样本,通过宏基因组测序技术,对粪便细菌进行物种注释、多样性分析和功能注释与分析。测序共获得424 716 776条有效序列,构建非冗余基因后共获得318 605个基因。Alpha多样性表明,和幼年组相比,成年组Chao1指数和Ace指数极显著提高(P < 0. 01),而Shannon和Simpson指数极显著降低(P <0. 01);Beta多样性分析表明,两组样本肠道菌群结构差异明显;物种注释结果表明,幼年组以乳杆菌属(Lactobacillus) 为主,成年组则以大肠埃希氏菌(Escherichia) 和链球菌属(Streptococcus) 为主,并在成年组中发现地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、半乳糖地质杆菌(Geobacillus galactosidasius) 和Thermoclostridium stercorarium 等具有木质纤维素降解潜力的低丰度细菌。功能注释结果显示,幼年组GT4、GH43、GH73、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、翻译、脂质代谢、核糖体结构和生物合成等通路富集程度显著高于成年组(P < 0. 05)。本研究基于宏基因组学解析了秦岭圈养大熊猫幼年和成年期肠道菌群特征与差异,挖掘到与木质纤维素分解相关的菌群,为后续促消化菌剂产品的研发,助力大熊猫精准营养管理和肠道健康提供重要依据。

关键词: 宏基因组学, 秦岭圈养大熊猫, 肠道菌群, 功能分析