兽类学报

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达乌尔黄鼠TRP基因家族鉴定及其在冬眠周期中的表达模式分析

刘子扬1  吕锦红2  李转霞1  王琳涓1  宋丰成1  袁峥嵘1*  邢昕2*   

  1. (1 北京林业大学生物科学与技术学院,北京 100083)

    (2 沈阳师范大学生命科学学院,沈阳 110034)

摘要:

冬眠是动物应对极端环境的低代谢适应策略。达乌尔黄鼠(Spermophilus dauricus)作为一种典型啮齿类冬眠动物,是研究冬眠生理机制的理想模型。瞬时受体电位(transient receptor potential, TRP)通道在温度感知、钙信号转导及代谢调控中发挥关键作用,但目前其在冬眠适应中的组成特征和表达动态尚未明确。本研究采用生物信息学方法对TRP基因家族进行全基因组鉴定与系统分析,结合实时定量聚合酶链式反应技术(Real-Time Quantitative Polymerase Chain Reaction, RT-qPCR),探究其在冬眠周期中的表达模式。结果显示,达乌尔黄鼠中共鉴定出25个TRP基因,可划分为TRPV、TRPM、TRPC、TRPA、TRPP、TRPML 6个亚家族,分布于11条染色体上,具有高度保守的核心结构域与进化特征,且与多纹黄鼠(Ictidomys tridecemlineatus)TRP基因家族存在广泛共线性关联。Trpm2、Trpm3、Trpc2等基因在冬眠期肝脏中表达水平显著升高(P < 0.05),呈现出明显的周期性表达模式。本研究系统阐释了达乌尔黄鼠TRP基因家族的组成特征及冬眠周期中的表达动态,为进一步解析冬眠动物温度感知与代谢适应的分子调控机制提供了基础。

关键词: 冬眠, 达乌尔黄鼠, TRP基因家族