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2026年 第46卷 第5期    刊出日期：2026-09-30

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不同生境类型和季节变化对布氏田鼠肠道菌群组成和群落组装的影响

张泽伟, 王思雨, 李国梁

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151207

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肠道微生物在宿主生理功能及生态适应中发挥了关键作用，探究不同生境类型及季节变化对其结构的影响，对于揭示宿主–微生物互作机制具有重要科学意义。本研究采集了夏季野外（FWS）、冬季野外（FWW） 以及夏季室内（FIS） 条件下布氏田鼠（Lasiopodomys brandtii） 的粪便样品，并基于16S rRNA基因的扩增子测序分析其肠道微生物的组成、共现网络、组装机制及预测代谢功能。结果表明，季节变化与生境类型均能显著塑造布氏田鼠的肠道微生物，且季节因素的影响更为显著。在生境对比方面，野外夏季个体（FWS） 由于高异质性的食物摄入及复杂的环境刺激，其肠道微生物的α多样性和共现网络复杂度显著高于室内夏季个体（FIS），其群落组装主要受确定性过程驱动（同质选择占比77. 8%），而长期处于恒定环境下的室内个体其网络结构趋于松散，组装模式向随机性过程（占71. 1%） 转变。在季节对比方面，冬季野外个体（FWW） 的菌群多样性降至最低，且核心菌群结构发生剧烈重构：厚壁菌门（Firmicutes） 等菌群相对丰度大幅降低，而拟杆菌门（Bacteroidota，主要为Muribaculaceae属） 爆发式升高，导致F/B比值大幅下降。尽管冬季菌群网络规模收缩，但其局部聚集度（聚类系数） 和关键节点的重要度显著增加，拮抗竞争加剧。此外，群落组装机制分析显示，从夏季到冬季环境定向选择压力减弱，生态漂变等随机过程的相对贡献有所增加。功能预测表明，冬季极寒和食物匮乏对菌群的基础代谢和三羧酸循环（TCA循环） 产生了广泛的抑制作用，但靶向激活了D⁃阿拉伯糖和乙醇酸代谢等特殊降解通路以维持宿主能量稳态；而野外环境相比室内则诱导了菌群在细胞膜/壁合成及特定氨基酸降解等细胞防御与多元营养利用上的代谢潜能。本研究系统揭示了布氏田鼠肠道微生物在极端资源及环境压力下的结构重组与功能同步谱系重塑，为深入理解野生动物的生态适应策略和宿主–微生物互作关系提供了重要依据。


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患病长江江豚肠道菌群多样性分析及病原菌分离鉴定

王润萍, 梅志刚, 饶榕城, 闵佳玲, 隗黎丽, 戴银根

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151076

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为探索长江江豚体表溃烂致病原因及其防治措施，以及科学评估长江江豚肠道菌群结构。本文基于对1头患病死长江江豚进行组织解剖、病理组织切片分析、肠道菌群组成（采用局部重复取样，将长江江豚肠道分为前肠、后肠和直肠3部分，各部分重复取3段，每段5 cm，取内容物进行检测） 及病原菌分离鉴定和耐药性试验等进行了分析研究。结果显示，长江江豚体型消瘦，体表多处溃烂；解剖后内脏充血、有腹水。长江江豚肠道菌群门水平上，直肠中Proteobacteria相对丰度显著性高于前肠和直肠（P < 0. 05）；属水平上，Enterococcus 在前肠中的相对丰度显著性高于后肠和直肠（P < 0. 05）；Fusobacterium 在后肠相对丰度中显著性高于直肠（P <0. 05）。同时，于体表病灶处分离获得潜在致病菌P2，经过16S rDNA 鉴定确定为嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila。药敏试验表明，菌株A. hydrophila P2对8种抗生素高度敏感，4种抗生素中度敏感，对18种抗生素具有强耐药性。综合分析，推测该长江江豚由于枯水期栖息水域环境发生显著变化，持续处于应激状态，免疫功能受到影响，感染致病菌嗜水气单胞菌（A. hydrophila P2），引发机体皮肤炎症和溃烂病变，并累及肾脏和肠道等组织器官，最终因摄食障碍导致机体严重消耗而死亡。研究结果为长江江豚细菌性疾病预防措施的研发提供了重要参考依据。


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食物偏好对哺乳期黑线仓鼠能量代谢和肠道菌群的影响

杜雅杰 赵真 张开元 曹静 赵志军

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151095

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食物的多样性和食物质量的季节性变化是野生小型哺乳动物必须应对的主要环境因子。哺乳期是动物能量需求最高的生活史阶段之一，在此期间对不同食物的选择偏好对确保哺乳期母体的能量需求和繁殖成功具有重要影响。本研究探讨了黑线仓鼠（Cricetulus barabensis） 在哺乳期分别摄取高蛋白、高脂肪、高纤维食物对其能量收支、繁殖输出及肠道微生物的影响。结果发现，黑线仓鼠显著偏好高脂食物，非繁殖期摄取高脂食物占总摄食量的59.8%，而哺乳期高达78.1%，而对照食物、高蛋白和高纤维食物仅占8.4%、3.3%和10.1%。与非繁殖期相比，哺乳期母体摄食量显著增加，静息代谢率亦显著提高，但摄取各种类型食物的母体最大摄食量均未超过对照组水平。摄取高蛋白和高纤维食物母体的泌乳输出、幼体的胎仔体质量均显著低于对照组和摄取高脂肪组。与非繁殖期相比，哺乳期母体消化系统质量显著增加，摄取高纤维食物组大肠和盲肠质量显著高于其他各组。盲肠厚壁菌门和拟杆菌门为门水平上的优势菌群，与对照组相比，高蛋白组厚壁菌门相对丰度降低，而拟杆菌门相对丰度升高；高纤维组和高蛋白组α多样性（ASVs数量、Chao1指数、Shannon指数）显著降低，而高脂食物组和摄取各种类型食物组未发生显著变化。结果表明，哺乳期黑线仓鼠对食物的选择具有显著的偏好，高蛋白食物具有较高食物特殊动力效应，可能是摄取比例较低的主要原因；消化系统可塑性可能达到瓶颈，在一定程度上限制了动物的选择偏好。摄取高纤维食物和高蛋白食物的母体未能通过增加能量摄入满足幼体的能量需求，泌乳能量支出显著降低是主要原因之一，这些变化可能与肠道微生物α多样性显著降低有关。食物资源可利用性的季节性变化对野生小型哺乳动物的季节性繁殖策略具有重要影响，仅利用高蛋白和高纤维食物会降低母体的繁殖价值。


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蝙蝠肠道微生物研究进展

黄鑫磊, 郎伟, 冯江, 刘博宇

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151100

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翼手目动物（俗称蝙蝠） 是物种多样性最高的哺乳动物类群之一，拥有丰富的种类和广泛的地理分布。不仅表现出多样化的食性，还具有独特的免疫系统和较长的寿命，使其在长期进化过程中形成了独特的适应机制。尽管蝙蝠作为多种病原体的宿主，却很少表现临床症状，这种现象可能表明蝙蝠具有较高的病原体耐受性或独特的免疫调控策略。蝙蝠肠道微生物群的组成和功能受到食性、栖息地与季节等多重因素的影响，呈现出一定的独特性。本文系统综述了蝙蝠肠道微生物群的组成特征，探讨了其与宿主食性之间的关联，并分析了微生物群对宿主健康的影响，以期为蝙蝠肠道菌群相关研究提供参考。


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同域中鼩鼱不同季节肠道菌群结构及功能研究

薛淇元, 蔡赫, 张亦飞, 高艺, 郭秋颖, 张智慧, 金志民, 张隽晟, 刘铸

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151122

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肠道菌群与宿主的行为、健康和发育密切相关，其受到季节、食物组成及环境等多种因素影响。为探究不同季节同域中鼩鼱（Sorex caecutiens） 的肠道菌群差异，本研究采集了夏、秋、冬3个季节的33号中鼩鼱样本对其肠道内容物进行了16S rRNA基因高通量测序，对测序结果物种注释后，分析肠道菌群的物种组成、α多样性、β多样性、组间差异和功能。结果显示，3个季节中鼩鼱肠道菌群的Simpson和Chao1指数无显著差异，冬季组的Shannon指数显著高于其他2个季节（P < 0.05）。β 多样性分析结果显示3个季节中鼩鼱的肠道菌群结构存在差异（P < 0. 01）。在门水平上，夏季和秋季的优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes）（分别为52.39%和53.21%）和弯曲菌门（Campylobacterota）（分别为23.42%和21.41%），冬季的优势菌门为变形菌门（Proteobacteria）（41. 15%） 和弯曲菌门（29. 27%）。属水平上，中鼩鼱夏季和秋季的优势菌属为支原体属（Mycoplasma）（分别为23.42% 和41.22%）、螺杆菌属（Helicobacter）（分别为21.94% 和21.41%）。冬季的优势菌属为螺杆菌属（29.27%）。LEfSe分析发现，厚壁菌门、疣微菌门（Verrucomicrobiota） 和脱硫菌门（Desulfobacterota） 在秋季大量富集，变形菌门、放线菌门（Actinobacteriota） 和拟杆菌门（Bacteroidota） 在冬季大量富集。功能分析结果显示，肠道菌群中代谢相关通路在3个组占绝对优势（相对丰度 > 75%），秋季肠道菌群中遗传信息处理通路丰度显著高于其他2个季节（P < 0.05）。通过对3个季节中鼩鼱肠道菌群的分析，初步了解中鼩鼱肠道菌群的组成及功能，且其随季节发生变化以适应食物的规律。



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食物限制下小型哺乳动物肠道微生物的跨尺度生理生态效应#br#

张天馨, 朱万龙

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151139

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食物限制是影响动物适应性策略的关键环境压力，其与肠道微生物的互作机制已成为近年来的研究热点。作为宿主的“第二基因组”，肠道菌群在帮助小型哺乳动物应对食物限制中扮演着核心角色。本综述首先系统分析了小型哺乳动物作为肠道微生物研究模型的独特优势。进而，我们详细梳理了完全禁食、部分禁食与营养限制等不同食物限制类型对宿主肠道菌群的差异化影响，重点阐释了食物限制通过重塑微生物群落结构、改变其代谢功能并影响微生物‐宿主互作来介导宿主生理适应的关键机制。本文整合阐述了食物限制通过肠道微生物产生的跨尺度生理生态效应：在个体层面，它调控能量平衡、免疫稳态与认知行为；在种群层面，则影响生殖发育与种群动态。展望未来，研究应聚焦于解析微生物组可塑性的分子基础、厘清其代际传递效应，并推动相关成果在野生动物保护与管理中的应用。本文构建的“食物限制‐肠道微生物‐宿主表型‐种群动态”框架，为深入理解动物对环境适应的生理基础提供了新视角。



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海南褐家鼠和黄胸鼠肠道菌群差异及共存机制探讨

高霄龙, 张万相, 翟红娟, 朱涵毅, 张知彬

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151156

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褐家鼠（Rattus norvegicus） 和黄胸鼠（Rattus tanezumi） 是海南热带地区近缘种，微环境分离被认为是共存的重要机制。肠道微生物在调节宿主生理功能和适应环境变化上发挥重要作用，因此，比较其同一生境下肠道微生物组成及功能差异，有助于从生理功能角度探讨其共存机制。为精准鉴定物种，本研究参考形态学指标，并结合COI基因DNA条形码技术区分捕获的鼠类物种。通过16S rDNA高通量测序分析，测定褐家鼠和黄胸鼠肠道微生物群落和功能特征。结果显示，经COI基因测序鉴定，确认34只家栖鼠中27只为褐家鼠、7只为黄胸鼠。黄胸鼠和褐家鼠肠道微生物的Alpha多样性（Shannon指数） 和Beta多样性差异显著，而同种鼠不同性别的个体肠道微生物多样性无显著差异；两鼠种在门、科、属水平的差异及菌群功能预测显示不同鼠种独特的生态适应性，具体表现为褐家鼠变形菌门（Proteobacteria）、乳杆菌科（Lactobacillaceae）、乳杆菌属（Lactobacillus） 等丰度高，具有杂食倾向，而黄胸鼠芽孢杆菌门（原厚壁菌门）/拟杆菌门比值较高，鼠杆菌科（Muribaculaceae） 和毛螺菌科（Lachnospiraceae） 等纤维分解菌丰度高、碳代谢（Carbon metabolism）、氨基酸生物合成（Biosynthesis of amino acids）通路活跃，具有植食性倾向。本研究说明，褐家鼠和黄胸鼠肠道微生物结构和功能存在显著差异，说明两者在食性偏好与生态适应策略上存在分异。本研究提出，肠道微生物差异与微环境分离协同作用可能有利于减少种间竞争，促进同域共存，为热带地区近缘鼠类物种共存机制研究提供了新的视角。


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秦岭圈养大熊猫幼年与成年期肠道菌群结构及功能差异解析

王斌鹏, 张丹辉, 杨志梅, 潘月婷, 罗晓斌, 莫然, 昝林森, 王晓宇, 梅楚刚

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151162

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本研究旨在通过宏基因组技术探究秦岭圈养大熊猫幼年和成年期肠道菌群结构和功能差异，为阐明秦岭圈养大熊猫的肠道菌群对不同阶段饮食的适应性响应、开发针对提高秦岭圈养大熊猫的促消化益生菌产品和改善其营养健康提供重要的理论依据。试验采集秦岭大熊猫研究中心饲养的3只幼年（2 ~ 4月龄） 和3只成年（62 ~ 63月龄） 大熊猫粪便样本，通过宏基因组测序技术，对粪便细菌进行物种注释、多样性分析和功能注释与分析。测序共获得424 716 776条有效序列，构建非冗余基因后共获得318 605个基因。Alpha多样性表明，和幼年组相比，成年组Chao1指数和Ace指数极显著提高（P < 0. 01），而Shannon和Simpson指数极显著降低（P <0. 01）；Beta多样性分析表明，两组样本肠道菌群结构差异明显；物种注释结果表明，幼年组以乳杆菌属（Lactobacillus） 为主，成年组则以大肠埃希氏菌（Escherichia） 和链球菌属（Streptococcus） 为主，并在成年组中发现地衣芽孢杆菌（Bacillus licheniformis）、半乳糖地质杆菌（Geobacillus galactosidasius） 和Thermoclostridium stercorarium 等具有木质纤维素降解潜力的低丰度细菌。功能注释结果显示，幼年组GT4、GH43、GH73、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、翻译、脂质代谢、核糖体结构和生物合成等通路富集程度显著高于成年组（P < 0. 05）。本研究基于宏基因组学解析了秦岭圈养大熊猫幼年和成年期肠道菌群特征与差异，挖掘到与木质纤维素分解相关的菌群，为后续促消化菌剂产品的研发，助力大熊猫精准营养管理和肠道健康提供重要依据。



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鼬超科动物肠道微生物组研究进展与展望

袁子雨, 刘一心, 胡义波

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151183

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鼬超科（Musteloidea） 是食肉目中物种、形态与生态适应分化显著的类群之一，涵盖肉食的鼬科（Mustelidae）、以杂食为主的浣熊科（Procyonidae） 和臭鼬科（Mephitidae），以及专性植食的小熊猫科（Ailuridae）。其在食性和栖息环境上的显著分化，为探讨动物宿主相关因子与肠道微生物组结构和功能之间的关系提供了重要的研究体系。尽管基于16S rRNA基因扩增子测序、宏基因组测序及多组学整合的研究逐渐增多，但针对鼬超科动物肠道微生物组的系统性认识仍然有限，现有研究总体呈现出零散和碎片化的特点。本文主要综述了近年来鼬超科动物肠道微生物组研究的主要进展，分别从鼬科、浣熊科、臭鼬科和小熊猫科的研究现状出发，总结其肠道微生物组的结构与功能特征，旨在为后续开展更深入、系统的相关研究提供参考框架。


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野生动物粪菌移植（FMT） 的建议性操作框架——从理论基础到保护应用#br#

沈文静, 张鑫, 高鹏, 闻靖, 薄亭贝

2026, 46(5):  1.  DOI: 10.16829/j.slxb.151213

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粪菌移植（faecal microbiota transplantation，FMT） 是修复野生动物肠道菌群、提升野化放归成功率的潜在技术手段，但目前该领域尚无统一操作规范。本文结合肠道微生物生态理论与国内外野生动物FMT实践案例，从供体筛选、技术实施、效果评估3个维度，构建适用于野生动物保护场景的FMT建议性操作框架。分析显示，现有案例普遍存在安全筛查不足、技术标准化程度低、长期动态监测缺失等问题，同时需警惕抗生素耐药基因、机会致病菌及人源微生物跨种群传播等风险。本框架明确了不同场景下的分级操作要求与伦理边界，可为野生动物救护、圈养管理及野化放归工作提供参考。后续仍需开展多物种、长期野外实证研究，以推动FMT从初步探索走向基于生态学原理的科学应用。