高原鼠兔四个地理种群的遗传多样性与遗传分化

摘要/Abstract

摘要： 采用7 个多态微卫星DNA 标记分析了4 个高原鼠兔地理种群(海晏种群、西大滩东种群、西大滩西种群和昆仑山种群)的遗传多样性和遗传分化。采用多态信息含量(PIC)、期望杂合度(H_e )、观测杂合度(H_o)、基因流(N_m )和基因分化系数(F_st)对种群及物种的遗传多样性水平进行分析;计算各种群间的遗传距离(GD)、遗传相似度(GI)以及遗传距离与地理距离的相关系数,并进行UPGMA 聚类分析。研究结果显示,高原鼠兔的遗传多样性在小哺乳动物中处于较高水平, 其H_e 和H_o 的平均值分别为0. 5332 和0. 6003, 其F_st 为0. 0975,即有9. 75% 的变异存在于种群之间,即变异主要存在于种群内部。4 个种群间的杂合度与多态信息含量均无显著差异,说明它们的遗传多样性水平基本相当。海晏种群与其余3 个种群的遗传分化均达到了中度分化水平(F_st = 0.1043),而另3 个种群间几乎没有分化(F_st = 0. 0253)。Mantel test 结果表明地理距离与遗传距离间没有显著的相关性。

关键词: 高原鼠兔, 微卫星, 遗传多样性, 遗传分化

Abstract: The plateau pika (Ochotona curzoniae) has a widespread distribution over the high alpine grassland of the Qinghai-Tibet Plateau of People's Republic of China.It is one of the most dominant small mammals and plays an important role in keeping the balance of the alpine meadow ecosystem. The aim of this paper was to investigate the level of genetic diversity and also to test the hypothesis of IBD (isolation by distance) for this old species. Samples of plateau pikas were collected from four natural populations (Haiyan,Xidatan E, Xidatan W and Kunlunshan populations). Genetic diversity and differentiation were assessed with seven polymorphic microsatellite markers. The genetic diversity of plateau pika was comparatively higher than that for some other small mammals (H_o = 0. 6003, H_e = 0.5332). The majority of genetic variation occurred within populations (F_st = 0.0975). The levels of genetic diversity of the four populations were similar. High genetic differentiation was encountered between Haiyan population and the other three (F_st= 0.1043)probably due to the long distance between them. However, the results of mantel test showed that there was no significant correlation between geographical distance and genetic distance.

Key words: Genetic diversity, Genetic differentiation, Microsatellite, Plateau pika (Ochotona curzoniae)

周乐, 杨生妹, 于智勇, 殷宝法, 淮虎银, 李世平, 魏万红. 高原鼠兔四个地理种群的遗传多样性与遗传分化[J]. .

ZHOU Le, YANG Shengmei, YU Zhiyong, YIN Baofa, HUAI Huyin, LI Shiping,WEI Wanhong. Genetic diversity and differentiation in four natural populations of plateau pika (Ochotona curzoniae)[J]. .

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[1]	吴昊, 梁英, 胡发涛, 伏海莉, 徐武成, 于鹏. 甘肃安南坝保护区野生双峰驼种群遗传多样性及其数量研究[J]. 兽类学报, 2026, 46(3): 349-357.
[2]	郗鸿原, 刘文静, 窦海龙. 狗獾全基因组微卫星分布规律及特征分析[J]. 兽类学报, 2026, 46(2): 184-198.
[3]	郭秋颖, 蔡赫, 杨柳青, 张智慧, 韩美凤, 赵婧瑜, 张春凤, 张隽晟, 刘铸. 山东小麝鼩分子系统地理学初步分析[J]. 兽类学报, 2026, 46(1): 129-139.
[4]	周睿, 宋梅玲, 王玉琴, 王宏生, 马源. 基于稳定同位素技术的高原鼠兔营养生态位特征[J]. 兽类学报, 2025, 45(4): 446-456.
[5]	唐小澄, 杨婧, 董艳民, 张洪亮, 沈延京, 王小萌, 鲍伟东. 北京松山国家级自然保护区野猪种群遗传结构初步分析[J]. 兽类学报, 2025, 45(3): 345-355.
[6]	吕泽龙, 李可欣, 胡义波. 全球野生猫科动物遗传多样性比较及其空间分布格局[J]. 兽类学报, 2024, 44(6): 795-803.
[7]	董昕, 陈慧青, 张璐, 尚国珍, 吴雁, 边疆晖. 食物中蛋氨酸含量对高原鼠兔肠道微生物群落的影响[J]. 兽类学报, 2024, 44(4): 411-426.
[8]	张阳, 陈璐瑶, 韩卫杰, 詹建文, 刘武华, 黄晓凤. 基于微卫星标记的江西桃红岭梅花鹿遗传多样性[J]. 兽类学报, 2024, 44(3): 268-276.
[9]	王玉军, 张晓茜, 方有贵, 杨其恩, 贾功雪. 高原鼠兔发情周期性激素与性器官变化特征[J]. 兽类学报, 2024, 44(3): 351-359.
[10]	郑凯丹, 汪巧云, 范朋飞, 韩雪松, 肖梅, 谌利民, 董正一, 张璐. 基于微卫星的欧亚水獭个体识别和遗传多样性[J]. 兽类学报, 2024, 44(2): 146-158.
[11]	赛青高娃, 王子涵, 李全邦, 王东, 连新明. 藏羚交配群成员间亲缘关系及遗传多样性分析[J]. 兽类学报, 2024, 44(2): 159-170.
[12]	张佳钰, 安志芳, 王志洁, 陈晓琦, 魏登邦. 高海拔环境抑制高原鼢鼠和高原鼠兔的胆汁酸代谢[J]. 兽类学报, 2023, 43(5): 553-567.
[13]	张璐, 吴学琴, 陈慧青, 董昕, 尚国珍, 吴雁, 边疆晖. 食物蛋白质含量对高原鼠兔免疫功能的影响[J]. 兽类学报, 2023, 43(3): 293-303.
[14]	邵伟伟, 乔芬, 蔡玮, 林植华, 韦力. 大蹄蝠全基因组微卫星分布特征分析[J]. 兽类学报, 2023, 43(2): 182-192.
[15]	田新民, 张明海. 基于粪便DNA的东北马鹿遗传多样性[J]. 兽类学报, 2023, 43(1): 41-49.

高原鼠兔四个地理种群的遗传多样性与遗传分化

Genetic diversity and differentiation in four natural populations of plateau pika (Ochotona curzoniae)

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