丁栋,沈菲菲,张保卫,李崇奇,张晨岭,周开亚,常青
DING Dong,SHEN Feifei,ZHANG Baowei,LI Chongqi,ZHANG Chenling,ZHOU Kaiya,CHANG Qing
摘要: 本文基于135 头野猪样本中检测到的15 种SLA DRB 基因exon 2 序列的遗传变异分析,探讨DRB 基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB 基因exon 2 抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2. 95 倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用。在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ 树中, 野猪DRB 位点的15 种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA - DRB nnu6 和人DRB 基因exon 2 片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同。野猪DRB 基因exon 2 的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA 等位基因变异的影响存在差异有关。