兽类学报 ›› 2026, Vol. 46 ›› Issue (4): 1-.DOI: 10.16829/j.slxb.151049

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基于转录组数据挖掘塔里木马鹿干旱环境 适应性相关基因

布威海丽且姆·阿巴拜科日1,2,3,4* 古丽米热·安外尔1,2 钟林强3 赵华斌4*   

  1. (1 新疆和田特色中医药研究重点实验室,和田 848000)

    (2 新疆和田学院医学技术学院,和田 848000)

    (3 新疆大学生命科学 与技术学院,新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐 830046)

    (4 武汉大学生命科学学院,武汉 430072)

  • 出版日期:2026-07-30 发布日期:2026-06-02

  • Online:2026-07-30 Published:2026-06-02

摘要: 塔里木马鹿(马鹿塔里木亚种 Cervus elaphus yarkandensis)对塔里木盆地极端干旱、炎热夏季和较强紫外线辐射具有很强的适应性。为了探讨该物种干旱环境适应性机制,本研究利用RNA测序技术(RNA‑Seq)对塔里木马鹿和东北马鹿(马鹿东北亚种 Cervus elaphus xanthopygus)皮肤组织进行转录组比较分析,筛选与塔里木马鹿干旱环境适应性相关的基因,利用实时定量PCR技术(qRT‑PCR) 检测验证RNA‑seq 结果的可靠性。结果表明,在塔里木马鹿中检测到的差异表达基因共有3 562个,其中1 279个基因上调表达,2 283个基因下调表达。上调表达的基因显著富集在通过皮肤调节水分损失、皮肤屏障的建立、水平衡等174个GO功能类别和类固醇激素生物合成、哮喘、花生四烯酸代谢等49个KEGG通路上;下调表达基因显著富集于发育过程的调节、血管生成发育、血压调节等453个GO功能类别和血小板活化、血管平滑肌收缩、ECM受体相互作用等60个KEGG通路上;qRT‑PCR分析结果显示,RNA‑Seq分析结果可靠。综上,在塔里木马鹿皮肤组织中差异表达的与皮肤屏障的建立、皮肤的水分和渗透调节、氧化应激、热应激、体温调节和免疫调节相关的基因可能参与该物种在极端干旱炎热环境中的应激反应和皮肤保护屏障的形成以及皮肤稳态的维持,以维持体温和防止水分流失,保护身体免受外部刺激。

关键词: 塔里木马鹿, 适应性, 干旱环境, 差异表达基因, RNA测序