Subspecies affiliation and population status of rhesus macaque in Qinghai, China

doi:10.16829/j.slxb.151002

Abstract

Abstract:

The rhesus macaque (Macaca mulatta) is the only non-human primate species currently living in Qinghai Province, distributed solely in the southern forest areas of Yushu and Guoluo Zang Autonomous Prefectures. Identifying the subspecies of wild macaques in Qinghai, understanding their population dynamics, and distribution is of great significance for their conservation. In January 2021, one muscle tissue (Baizha, Yushu) and six fecal samples (Makehe, Guoluo) of rhesus macaque were collected by non-invasive sampling, and a phylogenetic tree was constructed using the 16S rRNA and Cyt b genes. It confirmed that the rhesus macaques distributed in Yushu and Guoluo were the Tibetan subspecies (M. m. vestita) and the Sichuan subspecies (M. m. lasiotus), respectively. From January 2021 to May 2023, infrared camera monitoring yielded 91 present sites and 838 independent events of rhesus macaque. Using MaxEnt modeling, the suitable habitat area for macaques was predicted to be 137 - 385 km² (Baizha) and 207 - 750 km² (Makehe). The results indicated that rhesus macaques preferred the habitat of lower altitude, sloping, river-adjacent, sunny forests and farmlands. Transect surveys and random encounter model were used to estimate the macaque population. Following repeated transect surveys in winter 2021 and 2022, conducting at historical record sites (Baizha and Jiangxi in Yushu, Makehe in Guoluo), a total of 24 macaque groups with approximately 1 580 individuals were recorded, with an increase of 43.8% in individuals compared to 40 years ago. The random encounter model estimated the macaque population in Baizha and Makehe to be 73 - 205 and 413 - 1 497 individuals, respectively. The research can provide references and technical support for biodiversity conservation in Qinghai Province.

Key words: Rhesus macaque (Macaca mulatta), Subspecies, Population, Habitat, Infrared camera traps, Qinghai Province

摘要：

猕猴（Macaca mulatta）为国家二级重点保护野生动物，是青海省现生的唯一一种非人灵长类动物，仅分布于玉树藏族自治州和果洛藏族自治州的南部林区。明确青海省野生猕猴的亚种归属，掌握其种群动态及分布现状，对猕猴的有效保护具有重要意义。2021年1月，使用非损伤性采样方法，分别在青海省玉树白扎林区和果洛玛可河林区，获得猕猴1份肌肉组织样品和6份粪便样品。基于16S rRNA和Cytb基因序列的系统发育分析结果，确认分布于玉树和果洛的猕猴分别为西藏亚种（M. m. vestita）和川西亚种（M. m. lasiotus）。基于2021年1月至2023年5月红外相机监测数据，共获得猕猴存在位点91处，计838个独立事件。利用MaxEnt模型预测猕猴适宜栖息地面积分别为137 ~ 385 km²（白扎林区）和207 ~ 750 km² （玛可河林区），发现青海地区的猕猴偏好在海拔较低、有一定坡度、距河流较近、向阳的森林和耕地等生境中活动。2021年和2022年冬季，在猕猴历史记录地区（玉树白扎林区和江西林区、果洛玛可河林区）进行重复样线调查，共记录野生猕猴24群约1 580只，数量较40年前增长43.8%。采用随机相遇模型，估计白扎和玛可河林区猕猴种群数量分别为73 ~ 205只和413 ~ 1 497只。本研究可望为青海省的生物多样性保护提供基础数据和技术支撑。

关键词: 猕猴, 亚种, 种群数量, 栖息地, 红外相机, 青海省

CLC Number:

Q958.1

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Figures/Tables 7

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	附录A　猕猴MaxEnt模型结果（A：白扎，B：玛可河），包括接受者操作特性曲线ROC（1）、猕猴存在概率对各因子变量的响应曲线（2 ~ 6）及其刀切法检验结果（7）
	Appendix A　The results of MaxEnt model for rhesus macaque（A：Baizha，B：Makehe），including the receiver operating characteristic curve（ROC，1），response curves of macaque presence probability to variables（2 ‑ 6），and the jackknife test of variables（7）

位点 Locus	引物名称（5′ - 3′） Primers （5′ - 3′）	测序长度 Length/bp	参考文献 Primer reference	PCR扩增反应程序 Thermal cycling protocol
Cytb	L14724： CGAAGCTTGATATGAAAAACCATCGTTG	1 140	Irwin et al.， 1991	［30 s at 94 ℃， 30 s at 52 ℃， 70 s at 72 ℃］ × 35
Cytb	H15915： GGAATTCATCTCTCCGGTTTACAAGAC	1 140	Irwin et al.， 1991	［30 s at 94 ℃， 30 s at 52 ℃， 70 s at 72 ℃］ × 35
16S rRNA	fwd： CGCCTGTTTATCAAAAACAT	565	Guha et al.， 2007	［30 s at 94 ℃， 30 s at 48 ℃， 90 s at 72 ℃］ × 33
16S rRNA	Rev： CTCCGGTTTGAACTCAGATC	565	Guha et al.， 2007	［30 s at 94 ℃， 30 s at 48 ℃， 90 s at 72 ℃］ × 33

位点 Locus	引物名称（5′ - 3′） Primers （5′ - 3′）	测序长度 Length/bp	参考文献 Primer reference	PCR扩增反应程序 Thermal cycling protocol
Cytb	L14724： CGAAGCTTGATATGAAAAACCATCGTTG	1 140	Irwin et al.， 1991	［30 s at 94 ℃， 30 s at 52 ℃， 70 s at 72 ℃］ × 35
Cytb	H15915： GGAATTCATCTCTCCGGTTTACAAGAC	1 140	Irwin et al.， 1991	［30 s at 94 ℃， 30 s at 52 ℃， 70 s at 72 ℃］ × 35
16S rRNA	fwd： CGCCTGTTTATCAAAAACAT	565	Guha et al.， 2007	［30 s at 94 ℃， 30 s at 48 ℃， 90 s at 72 ℃］ × 33
16S rRNA	Rev： CTCCGGTTTGAACTCAGATC	565	Guha et al.， 2007	［30 s at 94 ℃， 30 s at 48 ℃， 90 s at 72 ℃］ × 33

环境变量 Environmental variables	模型贡献率 Percent contribution/%		置换重要值 Permutation importance/%
环境变量 Environmental variables	白扎 Baizha	玛可河 Makehe	白扎 Baizha	玛可河 Makehe
海拔 Elevation/m	59.0	49.2	62.0	75.2
距河流距离 Distance to river/m	18.2	8.8	17.9	8.5
坡向 Aspect/（°）	13.6	0.2	11.0	0.0
坡度 Slope/（°）	8.0	19.4	8.8	12.4
植被类型 Vegetation	1.2	22.5	0.2	3.9

环境变量 Environmental variables	模型贡献率 Percent contribution/%		置换重要值 Permutation importance/%
环境变量 Environmental variables	白扎 Baizha	玛可河 Makehe	白扎 Baizha	玛可河 Makehe
海拔 Elevation/m	59.0	49.2	62.0	75.2
距河流距离 Distance to river/m	18.2	8.8	17.9	8.5
坡向 Aspect/（°）	13.6	0.2	11.0	0.0
坡度 Slope/（°）	8.0	19.4	8.8	12.4
植被类型 Vegetation	1.2	22.5	0.2	3.9

县，林区 County， Forestry	地名 Site	经度 Longitude （E）	纬度 Latitude （N）	个体数 Individuals	历史调查区域（王玉学和郑杰，1986） Historical survey area
班玛，玛可河 Banma， Makehe	红军沟 Hongjungou	100°49′35″	32°46′26″	96	班前乡，青川交界处 Banqianxiang， Jucture of Qinghai and Sichuan
	依浪沟 Yilanggou	100°49′36″	32°40′41″	60	班前乡，青川交界处 Banqianxiang， Jucture of Qinghai and Sichuan
	俄沟 Egou	100°57′29″	32°38′36″	24	科培，灯塔，阿格玛，青川交界处 Kepei， Dengta， Agema， Jucture of Qinghai and Sichuan
	热洪沟 Rehonggou	100°53′58″	32°41′00″	55
	里沟 Ligou	101°02′29″	32°40′41″	43
	沙沟 Shagou	101°04′56″	32°44′48″	49
	友谊桥 Youyiqiao	101°06′45″	32°40′11″	32
	哑巴沟 Yabagou	101°07′39″	32°45′38″	44	哑巴沟，格日则，则囊 Yabagou， Golze， Zenang
	格日则 Golze	101°11′01″	32°44′12″	98	哑巴沟，格日则，则囊 Yabagou， Golze， Zenang
囊谦，白扎 Nangqian， Baizha	依羌诺 Yiqiangnuo	96°29′02″	31°48′04″	34	穷塘涌，日阿坡，呆日尕，尕藏青，日巴 Qiongtangyong， Riape， Dairiga， Gazangqing， Riba
	尕尔寺 Gaersi	96°29′08″	31°50′01″	87
	色青卡 Seqingka	96°34′16″	31°47′59″	43
	匝娘沟 Zanianggou	96°32′15″	31°49′37″	52	打旧涌，他们尕，江给 Dajiuyong， Tamenga， Jianggei
	阿岗尕 Agangga	96°39′59″	31°46′24″	102
	甘达寺Gandasi	96°45′15″	31°44′05″	71	日阿苏卡，青藏交界处 Riasuka， Jucture of Qinghai and Sichuan
玉树，江西 Yushu， Jiangxi	果拉弄 Guolanong	96°59′27″	32°07′43″	89	中枢卡，果拉陇，交腾尕日阿通 Zhongshuka， Guolalong， Jiaotenggariatong
	交腾，尕日阿果 Jiaoteng， Gariaguo	97°04′23″	32°10′17″	77	中枢卡，果拉陇，交腾尕日阿通 Zhongshuka， Guolalong， Jiaotenggariatong
	江达，达事弄 Jiangda， Dashinong	96°57′08″	32°04′36″	111	玉树玛，江达，达事陇，龙卡陇 Yushuma， Jiangda， Dashilong， Longkalong
	俄色陇 Eselong	97°03′57″	32°00′56″	80	玉树玛，江达，达事陇，龙卡陇 Yushuma， Jiangda， Dashilong， Longkalong
	吉热弄 Jirenong	97°12′47″	32°03′27″	104	草盖松多，吉热陇，尕哈陇，包雅陇 Caogaisongduo， Jirelong， Gahalong， Baoyalong
	草盖多 Caogaiduo	97°16′06″	32°05′06″	57	草盖松多，俄客格，玛垫陇 Caogaisongduo， Ekege， Madianlong
	巴龙弄 Balongnong	97°09′27″	32°03′37″	61	沙叶陇，巴陇格，加来达 Shayelong， Balongge， Jialaida
	沙叶弄 Sayenong	96°51′54″	32°19′36″	69	沙叶陇，巴陇格，加来达 Shayelong， Balongge， Jialaida
	甫兴高 Puxinggao	96°48′01″	32°02′23″	41